Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF9Q16594 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF9Q16594 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF9Q16594 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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