Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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KCNMB1Q16558 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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KCNMB1Q16558 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNMB1Q16558 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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KCNMB1Q16558 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNMB1Q16558 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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KCNMB1Q16558 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNMB1Q16558 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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KCNMB1Q16558 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMB1Q16558 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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KCNMB1Q16558 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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KCNMB1Q16558 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB1Q16558 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB1Q16558 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB1Q16558 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB1Q16558 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB1Q16558 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMB1Q16558 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
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