Protein–RNA interactions for Protein: Q16557

PSG3, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG3Q16557 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSG3Q16557 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSG3Q16557 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms