Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABRA6Q16445 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABRA6Q16445 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABRA6Q16445 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABRA6Q16445 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
GABRA6Q16445 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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