Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ALX1Q15699 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALX1Q15699 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALX1Q15699 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
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