Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGN3Q15651 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HMGN3Q15651 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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