Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNHIT3Q15649 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNHIT3Q15649 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNHIT3Q15649 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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