Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SF3A1Q15459 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SF3A1Q15459 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3A1Q15459 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SF3A1Q15459 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3A1Q15459 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3A1Q15459 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3A1Q15459 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3A1Q15459 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3A1Q15459 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3A1Q15459 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3A1Q15459 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3A1Q15459 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3A1Q15459 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3A1Q15459 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3A1Q15459 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3A1Q15459 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3A1Q15459 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms