Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEC23AQ15436 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC23AQ15436 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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SEC23AQ15436 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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SEC23AQ15436 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC23AQ15436 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC23AQ15436 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
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