Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF4Q15306 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF4Q15306 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF4Q15306 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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