Protein–RNA interactions for Protein: Q15287

RNPS1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1Q15287 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNPS1Q15287 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNPS1Q15287 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNPS1Q15287 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNPS1Q15287 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNPS1Q15287 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNPS1Q15287 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNPS1Q15287 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNPS1Q15287 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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