Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDK3Q15120 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDK3Q15120 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
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