Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NFIXQ14938 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NFIXQ14938 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NFIXQ14938 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.8 ms