Protein–RNA interactions for Protein: Q14739

LBR, Lamin-B receptor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBRQ14739 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBRQ14739 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBRQ14739 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBRQ14739 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBRQ14739 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBRQ14739 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBRQ14739 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LBRQ14739 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LBRQ14739 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LBRQ14739 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBRQ14739 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBRQ14739 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBRQ14739 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LBRQ14739 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBRQ14739 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBRQ14739 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBRQ14739 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBRQ14739 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LBRQ14739 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBRQ14739 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBRQ14739 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBRQ14739 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBRQ14739 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBRQ14739 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBRQ14739 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBRQ14739 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBRQ14739 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBRQ14739 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBRQ14739 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBRQ14739 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LBRQ14739 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBRQ14739 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBRQ14739 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBRQ14739 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBRQ14739 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBRQ14739 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBRQ14739 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBRQ14739 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBRQ14739 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBRQ14739 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBRQ14739 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBRQ14739 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBRQ14739 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LBRQ14739 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBRQ14739 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBRQ14739 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBRQ14739 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBRQ14739 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LBRQ14739 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBRQ14739 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBRQ14739 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBRQ14739 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBRQ14739 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBRQ14739 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBRQ14739 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBRQ14739 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBRQ14739 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBRQ14739 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBRQ14739 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LBRQ14739 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBRQ14739 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBRQ14739 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBRQ14739 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBRQ14739 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBRQ14739 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LBRQ14739 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBRQ14739 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBRQ14739 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBRQ14739 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBRQ14739 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBRQ14739 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBRQ14739 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBRQ14739 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBRQ14739 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBRQ14739 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LBRQ14739 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBRQ14739 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBRQ14739 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBRQ14739 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBRQ14739 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LBRQ14739 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LBRQ14739 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBRQ14739 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LBRQ14739 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBRQ14739 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LBRQ14739 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBRQ14739 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBRQ14739 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBRQ14739 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBRQ14739 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LBRQ14739 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBRQ14739 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBRQ14739 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBRQ14739 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBRQ14739 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBRQ14739 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBRQ14739 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBRQ14739 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBRQ14739 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LBRQ14739 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 577.1 ms