Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE4AQ14139 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE4AQ14139 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE4AQ14139 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE4AQ14139 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
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