Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNFAIP1Q13829 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNFAIP1Q13829 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
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TNFAIP1Q13829 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFAIP1Q13829 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
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