Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CUL4BQ13620 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CUL4BQ13620 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
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