Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNASE1L3Q13609 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNASE1L3Q13609 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNASE1L3Q13609 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DNASE1L3Q13609 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNASE1L3Q13609 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNASE1L3Q13609 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNASE1L3Q13609 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNASE1L3Q13609 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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