Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRF5Q13568 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRF5Q13568 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF5Q13568 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms