Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NEUROD1Q13562 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
NEUROD1Q13562 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
NEUROD1Q13562 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEUROD1Q13562 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
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