Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HDAC1Q13547 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HDAC1Q13547 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HDAC1Q13547 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HDAC1Q13547 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HDAC1Q13547 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDAC1Q13547 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDAC1Q13547 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HDAC1Q13547 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HDAC1Q13547 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HDAC1Q13547 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HDAC1Q13547 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HDAC1Q13547 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HDAC1Q13547 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HDAC1Q13547 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HDAC1Q13547 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDAC1Q13547 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDAC1Q13547 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDAC1Q13547 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
HDAC1Q13547 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HDAC1Q13547 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HDAC1Q13547 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
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