Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRPF4BQ13523 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF4BQ13523 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF4BQ13523 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF4BQ13523 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
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