Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNTB2Q13425 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNTB2Q13425 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms