Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MSLNQ13421 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MSLNQ13421 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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