Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS2P3Q13401 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMS2P3Q13401 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMS2P3Q13401 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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