Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3Q13114 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRAF3Q13114 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF3Q13114 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF3Q13114 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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