Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX10Q12887 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX10Q12887 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX10Q12887 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX10Q12887 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX10Q12887 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COX10Q12887 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COX10Q12887 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COX10Q12887 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COX10Q12887 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COX10Q12887 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COX10Q12887 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COX10Q12887 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COX10Q12887 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COX10Q12887 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COX10Q12887 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COX10Q12887 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COX10Q12887 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COX10Q12887 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COX10Q12887 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COX10Q12887 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COX10Q12887 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX10Q12887 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX10Q12887 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX10Q12887 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX10Q12887 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX10Q12887 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX10Q12887 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX10Q12887 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX10Q12887 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX10Q12887 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX10Q12887 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX10Q12887 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX10Q12887 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COX10Q12887 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX10Q12887 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX10Q12887 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COX10Q12887 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COX10Q12887 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX10Q12887 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX10Q12887 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX10Q12887 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX10Q12887 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX10Q12887 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX10Q12887 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX10Q12887 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COX10Q12887 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX10Q12887 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX10Q12887 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX10Q12887 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX10Q12887 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX10Q12887 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX10Q12887 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX10Q12887 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COX10Q12887 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COX10Q12887 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COX10Q12887 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COX10Q12887 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COX10Q12887 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COX10Q12887 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COX10Q12887 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COX10Q12887 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COX10Q12887 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COX10Q12887 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COX10Q12887 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COX10Q12887 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COX10Q12887 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COX10Q12887 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX10Q12887 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX10Q12887 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX10Q12887 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX10Q12887 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX10Q12887 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX10Q12887 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX10Q12887 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX10Q12887 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX10Q12887 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX10Q12887 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX10Q12887 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX10Q12887 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX10Q12887 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX10Q12887 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX10Q12887 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX10Q12887 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX10Q12887 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX10Q12887 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX10Q12887 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX10Q12887 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX10Q12887 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX10Q12887 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX10Q12887 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX10Q12887 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX10Q12887 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX10Q12887 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COX10Q12887 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX10Q12887 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COX10Q12887 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COX10Q12887 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX10Q12887 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX10Q12887 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms