Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SFSWAPQ12872 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFSWAPQ12872 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms