Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CXCL9Q07325 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CXCL9Q07325 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CXCL9Q07325 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms