Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBQ06643 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBQ06643 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBQ06643 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBQ06643 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBQ06643 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBQ06643 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBQ06643 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBQ06643 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBQ06643 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBQ06643 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBQ06643 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBQ06643 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBQ06643 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBQ06643 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBQ06643 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBQ06643 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBQ06643 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBQ06643 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBQ06643 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBQ06643 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBQ06643 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBQ06643 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBQ06643 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBQ06643 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBQ06643 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBQ06643 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBQ06643 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBQ06643 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBQ06643 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBQ06643 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBQ06643 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBQ06643 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBQ06643 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBQ06643 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBQ06643 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBQ06643 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTBQ06643 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBQ06643 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBQ06643 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBQ06643 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBQ06643 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBQ06643 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBQ06643 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBQ06643 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBQ06643 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTBQ06643 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBQ06643 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBQ06643 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBQ06643 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBQ06643 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBQ06643 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBQ06643 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBQ06643 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBQ06643 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBQ06643 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBQ06643 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBQ06643 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBQ06643 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBQ06643 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBQ06643 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBQ06643 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBQ06643 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBQ06643 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBQ06643 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBQ06643 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBQ06643 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBQ06643 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBQ06643 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBQ06643 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBQ06643 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBQ06643 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBQ06643 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBQ06643 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBQ06643 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LTBQ06643 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBQ06643 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBQ06643 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBQ06643 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBQ06643 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBQ06643 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBQ06643 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBQ06643 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBQ06643 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTBQ06643 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBQ06643 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBQ06643 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBQ06643 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBQ06643 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBQ06643 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBQ06643 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTBQ06643 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBQ06643 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBQ06643 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBQ06643 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBQ06643 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBQ06643 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBQ06643 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBQ06643 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBQ06643 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms