Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD51Q06609 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD51Q06609 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD51Q06609 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms