Protein–RNA interactions for Protein: Q06587

RING1, E3 ubiquitin-protein ligase RING1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RING1Q06587 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RING1Q06587 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RING1Q06587 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RING1Q06587 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RING1Q06587 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RING1Q06587 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RING1Q06587 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RING1Q06587 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RING1Q06587 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RING1Q06587 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RING1Q06587 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RING1Q06587 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RING1Q06587 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RING1Q06587 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RING1Q06587 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RING1Q06587 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RING1Q06587 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RING1Q06587 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RING1Q06587 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RING1Q06587 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RING1Q06587 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RING1Q06587 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RING1Q06587 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RING1Q06587 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RING1Q06587 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RING1Q06587 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RING1Q06587 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RING1Q06587 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RING1Q06587 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RING1Q06587 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RING1Q06587 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RING1Q06587 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RING1Q06587 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RING1Q06587 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RING1Q06587 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RING1Q06587 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RING1Q06587 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RING1Q06587 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RING1Q06587 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RING1Q06587 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RING1Q06587 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RING1Q06587 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RING1Q06587 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RING1Q06587 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RING1Q06587 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RING1Q06587 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RING1Q06587 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RING1Q06587 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RING1Q06587 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RING1Q06587 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RING1Q06587 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RING1Q06587 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RING1Q06587 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RING1Q06587 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RING1Q06587 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RING1Q06587 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RING1Q06587 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RING1Q06587 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RING1Q06587 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RING1Q06587 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RING1Q06587 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RING1Q06587 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RING1Q06587 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RING1Q06587 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RING1Q06587 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RING1Q06587 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RING1Q06587 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RING1Q06587 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RING1Q06587 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RING1Q06587 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RING1Q06587 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RING1Q06587 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RING1Q06587 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RING1Q06587 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RING1Q06587 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RING1Q06587 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RING1Q06587 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RING1Q06587 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RING1Q06587 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RING1Q06587 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RING1Q06587 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RING1Q06587 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RING1Q06587 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RING1Q06587 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RING1Q06587 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RING1Q06587 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RING1Q06587 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RING1Q06587 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RING1Q06587 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RING1Q06587 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RING1Q06587 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RING1Q06587 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RING1Q06587 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RING1Q06587 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RING1Q06587 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RING1Q06587 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RING1Q06587 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RING1Q06587 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RING1Q06587 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RING1Q06587 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms