Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PTK2Q05397 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTK2Q05397 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms