Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRB3Q04118 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRB3Q04118 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms