Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX5Q02548 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms