Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OC90Q02509 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OC90Q02509 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OC90Q02509 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OC90Q02509 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OC90Q02509 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OC90Q02509 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
OC90Q02509 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OC90Q02509 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OC90Q02509 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OC90Q02509 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OC90Q02509 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OC90Q02509 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OC90Q02509 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OC90Q02509 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OC90Q02509 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OC90Q02509 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OC90Q02509 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OC90Q02509 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OC90Q02509 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OC90Q02509 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OC90Q02509 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OC90Q02509 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OC90Q02509 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OC90Q02509 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OC90Q02509 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OC90Q02509 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OC90Q02509 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OC90Q02509 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OC90Q02509 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OC90Q02509 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OC90Q02509 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OC90Q02509 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OC90Q02509 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OC90Q02509 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OC90Q02509 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OC90Q02509 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OC90Q02509 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OC90Q02509 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OC90Q02509 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OC90Q02509 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OC90Q02509 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OC90Q02509 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OC90Q02509 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OC90Q02509 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OC90Q02509 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OC90Q02509 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OC90Q02509 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OC90Q02509 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
OC90Q02509 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OC90Q02509 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OC90Q02509 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OC90Q02509 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OC90Q02509 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OC90Q02509 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OC90Q02509 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OC90Q02509 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OC90Q02509 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OC90Q02509 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OC90Q02509 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OC90Q02509 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OC90Q02509 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OC90Q02509 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OC90Q02509 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OC90Q02509 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OC90Q02509 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OC90Q02509 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OC90Q02509 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OC90Q02509 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OC90Q02509 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OC90Q02509 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OC90Q02509 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
OC90Q02509 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OC90Q02509 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OC90Q02509 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OC90Q02509 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OC90Q02509 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OC90Q02509 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
OC90Q02509 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OC90Q02509 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OC90Q02509 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OC90Q02509 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OC90Q02509 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OC90Q02509 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
OC90Q02509 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OC90Q02509 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OC90Q02509 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OC90Q02509 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OC90Q02509 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OC90Q02509 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OC90Q02509 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
OC90Q02509 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OC90Q02509 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OC90Q02509 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OC90Q02509 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OC90Q02509 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OC90Q02509 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OC90Q02509 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OC90Q02509 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OC90Q02509 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms