Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFRSF17Q02223 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF17Q02223 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms