Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK16Q00536 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK16Q00536 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK16Q00536 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms