Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL11P62913 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL11P62913 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL11P62913 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL11P62913 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL11P62913 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL11P62913 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL11P62913 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL11P62913 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL11P62913 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL11P62913 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL11P62913 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL11P62913 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL11P62913 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL11P62913 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL11P62913 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL11P62913 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL11P62913 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL11P62913 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL11P62913 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL11P62913 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL11P62913 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL11P62913 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL11P62913 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL11P62913 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL11P62913 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL11P62913 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL11P62913 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL11P62913 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL11P62913 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL11P62913 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL11P62913 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL11P62913 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL11P62913 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL11P62913 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL11P62913 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL11P62913 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL11P62913 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL11P62913 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL11P62913 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL11P62913 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL11P62913 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL11P62913 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL11P62913 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL11P62913 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL11P62913 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL11P62913 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL11P62913 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL11P62913 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL11P62913 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL11P62913 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL11P62913 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL11P62913 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL11P62913 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL11P62913 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL11P62913 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL11P62913 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL11P62913 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL11P62913 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL11P62913 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL11P62913 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL11P62913 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL11P62913 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL11P62913 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL11P62913 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL11P62913 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL11P62913 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL11P62913 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL11P62913 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL11P62913 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL11P62913 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL11P62913 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL11P62913 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL11P62913 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL11P62913 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL11P62913 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL11P62913 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL11P62913 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL11P62913 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL11P62913 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL11P62913 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL11P62913 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL11P62913 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL11P62913 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL11P62913 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL11P62913 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL11P62913 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL11P62913 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL11P62913 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL11P62913 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL11P62913 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL11P62913 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL11P62913 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL11P62913 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPL11P62913 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPL11P62913 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPL11P62913 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL11P62913 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL11P62913 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL11P62913 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms