Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VSNL1P62760 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VSNL1P62760 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VSNL1P62760 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms