Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTA2P62736 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTA2P62736 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTA2P62736 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTA2P62736 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACTA2P62736 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTA2P62736 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTA2P62736 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174 ms