Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP1CAP62136 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1CAP62136 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms