Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LOXL3P58215 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LOXL3P58215 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LOXL3P58215 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms