Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX16P57768 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX16P57768 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX16P57768 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX16P57768 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX16P57768 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX16P57768 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX16P57768 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX16P57768 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX16P57768 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX16P57768 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX16P57768 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX16P57768 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX16P57768 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX16P57768 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX16P57768 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX16P57768 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX16P57768 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX16P57768 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX16P57768 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX16P57768 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX16P57768 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX16P57768 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX16P57768 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX16P57768 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX16P57768 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX16P57768 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX16P57768 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX16P57768 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX16P57768 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX16P57768 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX16P57768 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX16P57768 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX16P57768 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX16P57768 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX16P57768 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX16P57768 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX16P57768 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX16P57768 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX16P57768 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX16P57768 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX16P57768 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX16P57768 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX16P57768 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX16P57768 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX16P57768 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX16P57768 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX16P57768 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX16P57768 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX16P57768 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX16P57768 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX16P57768 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX16P57768 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX16P57768 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX16P57768 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX16P57768 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX16P57768 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX16P57768 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX16P57768 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX16P57768 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX16P57768 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX16P57768 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX16P57768 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX16P57768 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX16P57768 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX16P57768 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX16P57768 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX16P57768 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX16P57768 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX16P57768 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX16P57768 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX16P57768 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX16P57768 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX16P57768 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX16P57768 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX16P57768 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX16P57768 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX16P57768 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX16P57768 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX16P57768 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX16P57768 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX16P57768 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX16P57768 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX16P57768 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX16P57768 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX16P57768 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX16P57768 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX16P57768 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX16P57768 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX16P57768 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX16P57768 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX16P57768 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX16P57768 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX16P57768 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX16P57768 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX16P57768 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX16P57768 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX16P57768 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX16P57768 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX16P57768 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms