Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RP1P56715 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RP1P56715 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RP1P56715 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RP1P56715 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RP1P56715 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RP1P56715 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RP1P56715 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RP1P56715 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RP1P56715 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RP1P56715 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RP1P56715 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RP1P56715 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RP1P56715 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RP1P56715 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RP1P56715 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RP1P56715 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RP1P56715 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RP1P56715 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
RP1P56715 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RP1P56715 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RP1P56715 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RP1P56715 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RP1P56715 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RP1P56715 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RP1P56715 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RP1P56715 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RP1P56715 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RP1P56715 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RP1P56715 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RP1P56715 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RP1P56715 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RP1P56715 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RP1P56715 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RP1P56715 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RP1P56715 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RP1P56715 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RP1P56715 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RP1P56715 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RP1P56715 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RP1P56715 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RP1P56715 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RP1P56715 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP1P56715 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP1P56715 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP1P56715 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP1P56715 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP1P56715 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP1P56715 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP1P56715 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP1P56715 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP1P56715 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP1P56715 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP1P56715 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP1P56715 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RP1P56715 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RP1P56715 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RP1P56715 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RP1P56715 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RP1P56715 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RP1P56715 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RP1P56715 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RP1P56715 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RP1P56715 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RP1P56715 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RP1P56715 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RP1P56715 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RP1P56715 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RP1P56715 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RP1P56715 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RP1P56715 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RP1P56715 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RP1P56715 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RP1P56715 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RP1P56715 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RP1P56715 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RP1P56715 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RP1P56715 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RP1P56715 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RP1P56715 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RP1P56715 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RP1P56715 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RP1P56715 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RP1P56715 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RP1P56715 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP1P56715 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RP1P56715 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP1P56715 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP1P56715 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP1P56715 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP1P56715 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP1P56715 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP1P56715 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP1P56715 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP1P56715 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP1P56715 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP1P56715 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP1P56715 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP1P56715 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP1P56715 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms