Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME5P56597 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME5P56597 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME5P56597 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NME5P56597 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME5P56597 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME5P56597 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NME5P56597 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME5P56597 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME5P56597 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME5P56597 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME5P56597 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME5P56597 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME5P56597 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME5P56597 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NME5P56597 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME5P56597 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME5P56597 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME5P56597 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME5P56597 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME5P56597 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME5P56597 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME5P56597 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME5P56597 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME5P56597 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME5P56597 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME5P56597 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME5P56597 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME5P56597 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME5P56597 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME5P56597 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME5P56597 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME5P56597 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME5P56597 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME5P56597 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME5P56597 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME5P56597 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME5P56597 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME5P56597 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME5P56597 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME5P56597 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NME5P56597 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NME5P56597 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NME5P56597 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NME5P56597 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NME5P56597 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NME5P56597 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NME5P56597 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME5P56597 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME5P56597 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME5P56597 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME5P56597 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME5P56597 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME5P56597 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME5P56597 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME5P56597 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME5P56597 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NME5P56597 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME5P56597 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME5P56597 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME5P56597 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME5P56597 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NME5P56597 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NME5P56597 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME5P56597 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME5P56597 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME5P56597 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME5P56597 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME5P56597 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME5P56597 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NME5P56597 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME5P56597 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME5P56597 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME5P56597 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NME5P56597 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME5P56597 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NME5P56597 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME5P56597 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME5P56597 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME5P56597 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME5P56597 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NME5P56597 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME5P56597 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME5P56597 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME5P56597 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME5P56597 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME5P56597 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME5P56597 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME5P56597 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME5P56597 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME5P56597 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME5P56597 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NME5P56597 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME5P56597 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME5P56597 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME5P56597 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME5P56597 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME5P56597 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME5P56597 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NME5P56597 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms