Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF3BP55884 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF3BP55884 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF3BP55884 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms