Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCL23P55773 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCL23P55773 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCL23P55773 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCL23P55773 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCL23P55773 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCL23P55773 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCL23P55773 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCL23P55773 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCL23P55773 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCL23P55773 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCL23P55773 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCL23P55773 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCL23P55773 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCL23P55773 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCL23P55773 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCL23P55773 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCL23P55773 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCL23P55773 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCL23P55773 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCL23P55773 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCL23P55773 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCL23P55773 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCL23P55773 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCL23P55773 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCL23P55773 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCL23P55773 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCL23P55773 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCL23P55773 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCL23P55773 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCL23P55773 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCL23P55773 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCL23P55773 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCL23P55773 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCL23P55773 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCL23P55773 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCL23P55773 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCL23P55773 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCL23P55773 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCL23P55773 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCL23P55773 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCL23P55773 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCL23P55773 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCL23P55773 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCL23P55773 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCL23P55773 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCL23P55773 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCL23P55773 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCL23P55773 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCL23P55773 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCL23P55773 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCL23P55773 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCL23P55773 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCL23P55773 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCL23P55773 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCL23P55773 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCL23P55773 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCL23P55773 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCL23P55773 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCL23P55773 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCL23P55773 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCL23P55773 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCL23P55773 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCL23P55773 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCL23P55773 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCL23P55773 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCL23P55773 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL23P55773 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL23P55773 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL23P55773 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL23P55773 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL23P55773 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCL23P55773 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL23P55773 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL23P55773 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL23P55773 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL23P55773 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL23P55773 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL23P55773 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCL23P55773 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL23P55773 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL23P55773 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL23P55773 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCL23P55773 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCL23P55773 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCL23P55773 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCL23P55773 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCL23P55773 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCL23P55773 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCL23P55773 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCL23P55773 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCL23P55773 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCL23P55773 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCL23P55773 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCL23P55773 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCL23P55773 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCL23P55773 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCL23P55773 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCL23P55773 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCL23P55773 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms