Protein–RNA interactions for Protein: P55017

SLC12A3, Solute carrier family 12 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A3P55017 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC12A3P55017 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC12A3P55017 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms