Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRLP54845 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRLP54845 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRLP54845 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRLP54845 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRLP54845 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRLP54845 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRLP54845 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRLP54845 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRLP54845 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRLP54845 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRLP54845 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRLP54845 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NRLP54845 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRLP54845 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRLP54845 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRLP54845 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRLP54845 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRLP54845 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRLP54845 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRLP54845 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRLP54845 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRLP54845 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRLP54845 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRLP54845 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRLP54845 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRLP54845 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRLP54845 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRLP54845 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRLP54845 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRLP54845 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRLP54845 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRLP54845 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRLP54845 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRLP54845 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRLP54845 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRLP54845 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRLP54845 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRLP54845 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRLP54845 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NRLP54845 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRLP54845 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRLP54845 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NRLP54845 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRLP54845 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRLP54845 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRLP54845 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRLP54845 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRLP54845 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRLP54845 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRLP54845 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRLP54845 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NRLP54845 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRLP54845 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NRLP54845 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRLP54845 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NRLP54845 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRLP54845 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRLP54845 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRLP54845 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRLP54845 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRLP54845 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRLP54845 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NRLP54845 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRLP54845 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRLP54845 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRLP54845 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRLP54845 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NRLP54845 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRLP54845 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NRLP54845 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRLP54845 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRLP54845 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRLP54845 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRLP54845 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRLP54845 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRLP54845 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRLP54845 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRLP54845 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRLP54845 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRLP54845 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRLP54845 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRLP54845 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRLP54845 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRLP54845 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRLP54845 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRLP54845 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRLP54845 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRLP54845 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRLP54845 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRLP54845 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRLP54845 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRLP54845 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRLP54845 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRLP54845 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRLP54845 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRLP54845 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRLP54845 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRLP54845 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRLP54845 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms